@PHDTHESIS{ 2024:435127047,
 	title = {Caracterização fenotípica e genotípica de Klebsiella pneumoniae produtora de KPC: investigação da associação entre colonização e infecção},
 	year = {2024},
 	url = "http://bdtd.famerp.br/handle/tede/876",
 	abstract = "Introdução: As infecções nosocomiais são, frequentemente, associadas à Klebsiella pneumoniae produtora de KPC (Kp-KPC). O trato gastrointestinal funciona como um importante reservatório para essas cepas, e a colonização prévia é um importante fator de risco para o desenvolvimento da doença. Apesar disso, as razões pelas quais alguns pacientes com estados de saúde semelhantes e carreadores de Kp-KPC progridem para infecção, enquanto outros não, permanecem indefinidas. Objetivo: O objetivo deste estudo foi identificar determinantes genéticos presentes em isolados de Kp-KPC que possam contribuir para a transição da colonização para a infecção. Material e Métodos: Foi realizado um estudo retrospectivo entre maio de 2018 a junho de 2021, em que 374 isolados Kp-KPC obtidos de culturas de vigilância e amostras de infecção foram selecionados para análise do perfil fenotípico de resistência e tipagem molecular por XbaI-PFGE. Resultados: A população de Kp-KPC estudada apresentou uma ampla diversidade genética e resistência a quase todos os antibióticos testados. A maioria dos pacientes (69,8%) estava na UTI no momento em que foi realizada a coleta da amostra para análise microbiológica, demonstrando ser uma coorte que demanda cuidados especiais. A partir da tipagem por XbaI-PFGE, 51 isolados foram selecionados para uma caracterização mais detalhada e subdivididos em dois grupos: 24 Kp-KPC foram categorizados apenas como colonizadores (ONLYCOL) e 27, como colonizadores que transitaram para infecção (COLINFEC). Os Kp-KPC de ambos os grupos foram selecionados para o sequenciamento completo do genoma (WGS) e ensaios fenotípicos adicionais, como teste de produção de biofilme, perfil de suscetibilidade aos antibióticos e capacidade de infecção em Galleria mellonella. Os ensaios de resistência aos antibióticos e de biofilme não mostraram diferenças significativas entre os grupos ONLYCOL e COLINFEC. O Multi Locus Sequence Typing (MLST) revelou oito sequências tipo – ST, sendo aquelas do complexo clonal 258 (ST 11 e ST 340) predominante em ambos os grupos. Entretanto, a ST 16 esteve associada ao grupo COLINFEC (p = 0,034). O alelo blaKPC-2 esteve presente em todos os 51 isolados selecionados. Yersiniabactina e a toxina colibactina (clb-3) foram amplamente representativas em ambos os grupos. O replicon IncF foi prevalente entre os isolados e esteve mais associado ao gene blaKPC-2 no grupo COLINFEC. A análise genômica comparativa identificou sete anotações associadas ao grupo COLINFEC (p < 0,01), incluindo duas sequências de inserção (família IS5 e família ISNCY), uma protease (HtpX), uma proteína de choque térmico (IbpA), a proteína de antiterminação Q, a fosfolipase D e uma proteína hipotética. Por outro lado, anotações relacionadas ao metabolismo de metais, sais e minerais foram associadas ao grupo ONLYCOL. Kp-KPC do grupo COLINFEC mostraram maior virulência em larvas G. mellonella nas primeiras 24 horas de infecção, sendo que a linhagem ST 11-KL64 demonstrou alta mortalidade das larvas, mesmo em baixas concentrações. Conclusão: Em conclusão, este estudo relata elementos, especificamente, associados à infecção, como a ST 16 e sete anotações genéticas. Estas descobertas contribuem para a compreensão dos mecanismos moleculares subjacentes à patogenicidade de Kp-KPC e podem ter implicações para o desenvolvimento de futuras intervenções direcionadas à prevenção.",
 	publisher = {Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde},
 	note = {Faculdade 1::Departamento 1}
}